Antecedentes: Los descriptores fractales derivados de la resonancia magnética estructural han mostrado ser prometedores para captar cambios cerebelosos relacionados con la edad con mayor sensibilidad que la morfometría euclidiana convencional. Sin embargo, los flujos de trabajo existentes suelen depender de la selección manual de regiones, la aproximación de tejidos basada en umbrales y la calidad de imagen dependiente de la secuencia, lo que limita la reproducibilidad y la traslación clínica multicéntrica. Métodos: Proponemos CerebFracPipe, una canalización integral que transforma la resonancia magnética de rutina en un vector estandarizado de biomarcadores fractales cerebelosos, z = Φ(I) = [Dcortex, DWM, Dcontour, Dskeleton, …]. La canalización integra (i) segmentación mediante aprendizaje profundo consciente de la secuencia del cerebelo, el vermis y los lóbulos; (ii) estandarización de intensidades y remuestreo consciente de la resolución; (iii) estimación fractal multi-escala mediante box-counting/Minkowski sobre máscaras anatómicamente definidas; (iv) armonización por lotes utilizando ajuste de localización/escala tipo ComBat con covariables biológicas; y (v) control de calidad automatizado y cuantificación de la incertidumbre mediante análisis de estabilidad frente a perturbaciones y muestreo de Monte Carlo. Resultados: En experimentos numéricos controlados, el estimador fractal propuesto recuperó dimensiones de referencia conocidas para objetos tridimensionales canónicos (por ejemplo, esponja de Menger: estimación 2.727 frente al valor teórico log 20/log 3) y demostró que las puntuaciones de incertidumbre aumentan de forma predecible bajo perturbaciones de la segmentación. En entornos simulados multisitio, la armonización redujo los efectos residuales del sitio desde niveles altamente significativos hasta valores despreciables, preservando al mismo tiempo las tendencias asociadas a la edad. Conclusiones: CerebFracPipe proporciona un estándar práctico y reportable para biomarcadores fractales cerebelosos reproducibles, permitiendo estudios multicéntricos armonizados y apoyando futuras aplicaciones clínicas como el modelado normativo y la detección temprana de la degeneración cerebelosa.